盐酸用于水解淀粉制造淀粉糖浆。在制造柑橘罐头时，盐酸用于脱去橘子囊衣。方法为:将去皮的橘瓣置于浓度为0.1%的盐酸中，于30~35℃下放置20min，待果胶水解后取出以流水漂洗，再用0.8%于35~40℃下漂洗20min左右，除去囊衣后再用流水漂洗以除去残留物和碱液。此外，盐酸还可用作pH值调节剂和淀粉改良剂等，在食品中不得残留，食品终制成前须除去或中和掉。例如，制化学酱油时，将蒸煮过的豆饼等原料浸)泡在含有一定量盐酸的溶液中，保持一定温度，盐酸具有催化作用，能促使其中复杂的蛋白质进行水解，经过一定的时间，就生成具有鲜味的氨基酸，再用(或用纯碱)中和，即得氨基酸钠。制造味精的原理与此差不多。
盐酸是胃液的一种成分（浓度约为0.5%），它能使胃液保持胃蛋白酶所需要的适合的pH值，它还能使中的蛋白质变性而易于水解，以及随食物进入胃里的细菌的作用。在分析化学中，用酸来测定碱的浓度时，一般都用盐酸来滴定。盐酸常用于溶解固体样品以便进一步分析，包括溶解部分金属与碳酸钙或氧化铜等生成易溶的物质来方便分析。
盐酸对人体的伤害主要还是来自于酸性，氯离子本身对人体可以说是没啥毒性的。实际上pH接近中性的盐酸当水喝当然是没有问题的（前提是没有其它有毒杂质）高浓度盐酸因为酸性很强，所以误食的话容易对消化道粘膜造成很严重的损伤，或者诱发溃疡日常生活中，高浓度的蒸汽或者盐酸烟雾，对呼吸道的伤害比较大日用品中含盐酸？应该主要是酸性的清洗剂里面。这样的话一般是没啥危害的，只要你不去吃，但是对皮肤可能会有一点刺激性。
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